Переселение солдат с семьями из деревянных казарм в каменные продолжалось с 1804 по 1810 год. Часть освобождавшихся территорий с садами и огородами передавалась городу, другая оставалась в ведении Измайловского полка.
В каждой казарме были отдельная ротная кухня и столовая. Во внутренних дворах помещались места для отхожих мест и прачечных, колодцы, многочисленные хозяйственные постройки.
В 1806 году для определения хозяйственных потребностей каждого полка и каждой казармы был создан комитет, состоявший из командиров Преображенского, Семеновского, Измайловского и других полков, в его состав также входили инспектор Инженерного департамента Военного министерства инженер-генерал К. И. Опперман и архитектор Л. Руска. Заключения комитета подавались императору на утверждение.
С 1808 года починкой, отоплением и освещением казарм заведовала специальная служба. Зимой в казармы отпускалось по одной сажени дров из расчета на десять человек в месяц, а летом — по два аршина дров на то же количество человек. Свечи выдавались на зимние месяцы по две штуки в сутки.
В 1809 году было предложено учредить при Инженерной экспедиции отделение для заведования всеми гвардейскими казармами и при нем особый комитет по составлению и согласованию смет на ремонтные работы. Так, осмотрев гвардейские казармы, архитектор Л. Руска составил смету на их ремонт, исчислявшуюся в 51,886 рублей. Благодаря работе особого комитета, в 1809 году были перестроены каменные казармы на Измайловском проспекте (арх. А. Д. Захаров), а также лейб-гвардии офицерский корпус (Дом Гарновского) у Измайловского моста (арх. Л. Руска).
В 1809 году граф А. А. Аракчеев по поручению императора представил доклад, в котором указал на необходимость создания при Инженерной экспедиции особого органа под названием «Управление Главного попечителя» или «Попечительство гвардейских казарм». В 1810 году Александр I высочайше утвердил «Положение о содержании гвардейских казарм», согласно которому казармы, дома и другие военные строения Измайловского, Преображенского, Семеновского и других полков, а также артиллерийского батальона были переданы в ведение Инженерной государственной военной коллегии. Средства, отпускавшиеся на содержание гвардейских казарм, были существенно увеличены. В 1810 году главным попечителем гвардейских казарм был назначен генерал-майор А. Н. Сухарев. В его штате числились: один штаб-офицер, два архитектора и два их помощника, письмоводитель с писцами. Главный попечитель принимал казенные здания по описи, составлял списки ветхих домов, работал с чертежами, следил за чистотой в казармах, лазаретах и других строениях, а также своевременно проводил их починку и плановый капитальный ремонт; для проведения мелких ремонтных работ при каждой казарме существовал штат мастеров.
Выстроенные в «неприличных местах» офицерские и солдатские хозяйственные постройки предписывалось уничтожать. Незастроенные участки разрешалось передавать во временное пользование на срок несения службы полковым чиновникам, женатым и холостым солдатам, объединенным в полковые артели; генеральные планы таких участков хранились в Военном министерстве. Так, в Измайловском полку под огороды были выбраны участки в районе 1-й Роты и между 10-й и 9-й Ротами.
Главный попечитель следил за взиманием платежей с полковых доходов — за сдачу в аренду полковой земли под размещение лавок, бань, огородов и прочего. Собранные средства направлялись на содержание в исправности полковых плац-парадных мест. Инженерная экспедиция уведомляла полковых командиров, чтобы они своевременно предоставляли попечителю точные сведения о получаемых доходах, но ни один из полков не выполнял этого требования. По согласованию с императором военный министр М. Б. Барклай-де-Толли признал возможным оставить эти доходные статьи за полками.
За внутренним порядком следил командир полка. Испорченное имущество приводилось в порядок в течение кратчайшего срока архитекторами попечительства за счет полка. От такой ответственности командир полка освобождался только в случае выступления в поход. Приняв казармы по подробной описи, вплоть до возвращения полка попечитель обязан был наблюдать за содержанием казарм, чистотой зданий и дворов и прочего. Годовая сумма общего казарменного бюджета составляла 363 684 рубля, из нее на нужды Измайловского полка выделялось 14 060 рублей.
Отопление казарм ежегодно стоило казне 170 160 рублей. Измайловский полк тратил на эту статью 39 676 рублей ежегодно. Немалые суммы расходовались на приобретение масла и свечей. По табелю 1811 года на десять человек назначалось в сутки по две свечи. Для освещения казарменных коридоров определялось на каждый фонарь в сутки по ¼ фунта масла. Стоимость свечей и масла исчислялась по справочным ценам Городской думы. Вывозку нечистот и снега должны были производить сами полки, получая на эти нужды 6 240 рублей. Очистка дымовых труб полкам не доверялась ввиду опасности пожаров. Эти работы проводились по распоряжению Инженерной экспедиции через подрядчиков — печников. Военное ведомство освобождалось от расходов на содержание тротуаров и мостовых, эта обязанность была возложена на думу.
Война 1812 года поглотила все средства государства: о строительстве или капитальном ремонте каких-либо каменных казарм не могло быть и речи. Только в 1817 году Инженерный департамент начал перестройку Измайловских казарм. Обновленный солдатский корпус № 1 был переоборудован в госпиталь, в 1818 году к Дому Гарновского пристроили каменный манеж, в 1819 году построили конюшню на сто пятьдесят лошадей и кузницу.
С 1810 по 1820 год Инженерному ведомству были переданы все городские и загородные казармы, которые разделили на отделения. Казармы Измайловского полка и других полков, расположенные за рекой Фонтанкой, вошли в состав третьего отделения. Казармы каждого отделения находились в ведении капитана или штабс-капитана, которому подчинялись смотрители и состоявшие при них нижние чины. За каждыми двумя отделениями наблюдал штаб-офицер.
В 1841 году провели новую перестройку казарм, к которым подвели трубы для поступления воды из Фонтанки. На участке перед казармами, расположенными по Измайловскому проспекту, был устроен палисадник, с трех сторон каждую казарму огородили каменным забором. Линия заборов с восточной стороны заканчивалась улицей Гарновского (Советский переулок), с западной стороны — безымянным (Якобштадтским) переулком. Вдоль этих переулков находились хозяйственные помещения, конюшни и прочее.
Архитектурный облик ротных одноэтажных казарм сохранялся до 1880-х годов, а общая планировка казарменного городка и местоположение зданий дошли до наших дней.
В 1874 году был принят закон о всеобщей воинской повинности, согласно которому для солдат служба в армии сократилась с двадцати до трех — пяти лет. В армию призывались лица мужского пола, достигшие двадцати лет, в казармах селились без семей и весь срок службы находились на казарменном положении.
В связи с изменениями сроков и порядка несения службы требовалась и перестройка солдатских казарм. В 1870–1880-х годах инженер А. А. Карбоньер построил новую казарму на Измайловском пр-ту, 9, присоединив к ней флигели. В 1878 году архитектор Н. Н. Аршеневский перестроил солдатскую казарму по Измайловскому пр-ту, 15, в 1905 году она была надстроена. В 1883–1885 годы военный инженер Г. М. Житков на месте прежних казарм построил новые каменные здания по Измайловскому пр-ту, 6, 8 и 12. В 1890 году был перестроен дом по Измайловскому пр-ту, 17, который предназначался для госпиталя.
В 1899 году одна из бывших казарм лейб-гвардии Измайловского полка (Измайловский пр-т, 13) находилась в собственности лейб-гвардии 2-й артиллерийской бригады, основной казарменный комплекс которой располагался на угловом участке Лермонтовского и Рижского проспектов.
